元素百科为您介绍：分子动力学是能够实现DNA运动模拟的一种技术，这些运动包括折叠成双倍、三倍或四倍的DNA链，以及DNA与蛋白质和药物的相互作用。分子动力学是用来处理那些发生时间从皮秒到分钟的运动过程，也适用于不同尺寸的分子系统，从几纳米到一米。

DNA分子模型研究

巴塞罗那生物医学研究所，分子模拟和生物信息学实验室的莫德斯托奥罗斯科正在领导一项研究，通过开发几种理论方法，在更大的时空尺度上并专注于生物医学与生物技术应用热点，来更好地了解生物大分子的行为特点，尤其是核酸。

今天，该研究团队在《自然方法》期刊上发表了一个新模型，这个模型能够以非凡的准确性，实现DNA动力学原子水平上的模拟，这个成就是5年的工作积累和超过100个DNA系统测试的结果。

研究数据存储在一个公共网站上，目前拥有超过4TB的信息。这个网站可以通过西班牙生物信息研究所和ELIXIR-Excellerate网络登录。ELIXIR-Excellerate网站是目前欧洲最大的生命科学数据网站。

科学家们已经开发出一套名为“力场”的数学函数，来描述形成DNA的原子的运动。“力场之前从来没有研究与生物现象相关的时间尺度上的不同结构，”巴塞罗那生物医学研究所的研究员，也是该论文的第一作者Pablo Dans Puiggròs说。

此外，作者提到了首个在线工具，致力于模拟核酸，并强调“这个工具能够预测DNA的性能，结果可以直接与实验相比”。我们希望这个新的工具和方法能够将我们的工作向公众普及：”该项目主任莫德斯托 奥罗斯科说。

DNA分子模型应用

这个工具有很广阔的前景，应用范围从生物医药到纳米技术领域，提供DNA调控机制的信息，而且有助于改善直接或间接靶向DNA的药物的设计。“我们实现了DNA原子模拟质量在定量研究上的一次飞跃。” Pablo Dans Puiggròs.说。

“提高模拟技术将使我们更加明确理论模型的定义，这个模型能够让我们模拟细胞生命的关键环节，仅仅依靠物理和化学的基本规律，就能完成描述生物行为的梦想，”莫德斯托奥罗斯科说，他也是巴塞罗那大学生命科学系主任和资深教授。

                                                                                                       责任编辑：qxl

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