近日,来自中国医学科学院北京协和医学院、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、中南大学、苏州大学和湖南大学的研究人员发现新型冠状病毒2019-nCoV基因组编码至少27种蛋白质,其中包括4种结构蛋白(S、E、M和N),15种非结构蛋白和8种辅助蛋白。
新型冠状病毒与2019-nCoV与SARS-CoV、MERS-CoV同属于β冠状病毒属。冠状病毒属于巢病毒目,冠状病毒科,冠状病毒属。冠状病毒属细分为α、β、γ和δ等四个属,是一类带有包膜,基因组全长约为30Kb的单股正链RNA病毒,是目前已知RNA病毒中基因组最大的病毒,迄今已发现的可感染人的冠状病毒HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、MERS-CoV和2019-nCoV。
数据还显示2019-nCoV的基因组与蝙蝠SARS-like CoV(MG772933)的基因组具有最高相似性。相比之下,2019-nCoV与MERS-CoV的进化距离较远,亲缘关系也不密切。针对pp1ab、pp1a、E、M、7a和N基因的编码蛋白的系统进化树分析显示2019-nCoV最接近于蝙蝠SARS-like CoV。就S基因而言,2019-nCoV最接近于蝙蝠冠状病毒,而它的3a和8b基因都最接近于SARS-CoV。尽管不论是在整个基因组上还是在单个基因上的系统进化树分析都明确表明,2019-nCoV与蝙蝠SARS-like CoV存在最密切的亲缘关系,但研究人员并没有发现单个蝙蝠SARS-like CoV毒株含有的所有蛋白都与2019-nCoV最为相似,新型冠状病毒2019-nCoV与SARS-CoV在结构和功能上存在差异。这也解释了为什么2种病毒在传染强度、肺炎病症、致死率等方面有明显不同。
参考文献:Wu A.P. et al. Genome composition and divergence of the novel coronavirus (2019-nCoV) originating in China. Cell Host & Microbe, 2020.