元素百科资讯频道:本文主要探讨诺如病毒的基因组特征及变异。诺如病毒为单股正链RNA 病毒,基因组全长约7.6kb,由3个开放读码框(open reading frame,ORF) 组成。
ORF1 编码一个约194 kD的非结构性多聚蛋白,ORF2 编码一个约60 kD 的主要结构蛋白VP1,ORF3 编码一个小的病毒相关蛋白,该蛋白可能与基因组包装成病毒体以及维持衣壳蛋白稳定性有一定关系。
ORF2 编码的衣壳蛋白进一步分为S区和P区,两者通过铰链相连。S 区主要涉及二十面体外壳的形成,P 区从外壳向外形成突起部分,P 区又分为P1 区和P2 区。P1 区突出于外壳表面,形成一个突出的柄状结构,P2 区位于P1 区的顶部,从而形成一个突出于外壳最表面的结构域,该区域可以与多糖类抗原( CHOs) 和抗体结合。
目前,基于主要衣壳蛋白基因序列的不同可分为五种基因群( GⅠ,GⅡ,GⅢ,GⅣ,GⅤ) ,共分为164 株,29 种不同基因型。
诺如病毒 的一大特点就是不同型别之间的重组频繁发生,重组经常发生于GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4 和GⅡ.12 之间,基因重组是诺如病毒 进化的主要策略和动力。
由于病毒基因组的频繁重组,使得诺如病毒 有很多变体。据报道,自20 世纪90 年代中期以来,世界范围内诺如病毒 的爆发流行都与GⅡ型有关,目前,GⅡ.4型是世界范围内的优势流行株。
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