研究人类微生物组对于人类健康具有重要意义,不仅能够为多种慢性疾病的病因提供新的见解,利于慢性病的防治,而且帮助人类在新药研发和个体化用药方面取得突破性进展。而最近的研究表明,微生物在有些癌症中发挥着重要作用,然而,微生物对不同类型癌症的贡献程度和诊断意义仍不清楚。
最近,发表在《自然》杂志上的一篇研究成果显示,来自美国的科研团队重新检查了10481名患者18116个样本的微生物读数,以及《癌症基因组图谱》(TCGA)全基因组测序(WGS;n=4831)和全转录组测序(RNA seq;n=13285)研究的33种癌症,在大多数主要癌症患者及其组织和血液中发现了独特的微生物特征。
研究人员使用了非常严格的去污染分析,丢弃了高达92.3%的总序列数据,还是发现在应用于Ia-IIc期癌症和目前缺乏在两个商业级无细胞肿瘤DNA平台上测量的基因组改变的癌症时,这些TCGA血液特征仍具有预测性。
研究人员对患有前列腺癌,肺癌或皮肤癌(共100例)以及健康,无癌症和无HIV的对照参与者(n = 69)个体的血浆样本进行深度宏基因组测序表明,无细胞微生物谱可用于实现健康对癌症和癌症对癌症的区分。 这些发现表明,一类新的基于微生物组的癌症诊断工具可以补充现有的ctDNA检测方法,以检测和监测癌症。
这种对微生物种群随癌症变化方式的新认识使基于微生物的诊断技术得到合理发展,可能开辟一条全新的治疗途径。
参考文献:Gregory D. Poore, Evguenia Kopylova, Qiyun Zhu, Robert Heaton, Rana Mckay, Sandip Pravin Patel, Austin D. Swafford ,Rob Knight.et al. Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach. Nature. 2020. DOI https://doi.org/10.1038/s41586-020-2095-1